我國的制藥工業(yè)分為化學藥品原料藥制造、化學藥品制劑制造、中藥飲片加工、中成藥生產(chǎn)、獸用藥品制造、生物藥品制造和衛(wèi)生材料及醫(yī)藥用品制造7個子行業(yè)。在這些子行業(yè)中，污染負荷量zui大的是化學藥品原料藥生產(chǎn)，約占全行業(yè)的80%。
中國化學制藥工業(yè)協(xié)會環(huán)保工程師張道新表示，化學原料藥生產(chǎn)一般都是投入產(chǎn)出比大，產(chǎn)品產(chǎn)出率低，污染物產(chǎn)生量較大；產(chǎn)生的污染物的種類、特性與數(shù)量，與生產(chǎn)品種所需原輔料、工藝過程、工藝條件、產(chǎn)出物及管理水平的直接相關。其特點是，污染物種類多、單類數(shù)量少（經(jīng)濟利用度不高）、具有生物毒性、濃度高、排放基本無規(guī)律、不連續(xù)不均衡、難進行生化處理。“高濃度廢水治理一直是困擾化學原料藥生產(chǎn)發(fā)展的難題。”
據(jù)了解，化學原料藥的廢水來源包括車間工藝用水、設備管線清場清洗廢水、藥物提取或精制工序固液分離產(chǎn)生的廢水、車間員工清潔用水及廠區(qū)生活廢水等。同時，廢水來源還包括鍋爐排污水、外排的冷卻水等。在企業(yè)的廢水中，廢水中則溶入了生產(chǎn)過程中使用的全部物料成分，其中包括藥物中間體、未知物和目標物（殘留的產(chǎn)品）；還包括廢水在混合有氧與缺氧條件下的新產(chǎn)物。
在國家水專項調(diào)研中，制藥企業(yè)的達標狀況堪憂：能夠達到制藥行業(yè)水污染物排放新標準限值的制藥企業(yè)數(shù)量相當少，化學合成類、發(fā)酵類、制劑類制藥廢水達標率分別為9%、12%和30%。
另據(jù)調(diào)查，目前國內(nèi)大部分城鎮(zhèn)污水處理廠對制藥工業(yè)廢水的納水要求為COD≤300mg/L，即使這樣，仍有部分化學合成類、發(fā)酵類制藥企業(yè)達不到要求，化學合成類比例高達46%，發(fā)酵類為16%。
化學原料藥生產(chǎn)廢水處理難度大的另一個原因，就是企業(yè)根據(jù)市場需求經(jīng)常調(diào)整產(chǎn)品與產(chǎn)量，新生產(chǎn)狀況產(chǎn)生的污染負荷與原處理設施的生物系統(tǒng)、運行參數(shù)發(fā)生沖突，往往會造成一段時間的不達標的問題。
以化學原料藥廢水污染治理為例介紹說，“不同產(chǎn)品、不同工藝、不同生產(chǎn)裝備、不同管理水平產(chǎn)污量大不相同，不同的企業(yè)不能用類同的治理技術與工藝治理。”