生化脫氮在污水處理中應(yīng)用得十分普遍，但并不是每個效果都很好的，據(jù)調(diào)查發(fā)現(xiàn)，目前，污水處理廠的生化系統(tǒng)普通脫氮效果都比較差，并沒有達(dá)到原來設(shè)想的經(jīng)濟(jì)性。這是為什么呢？
引起生化系統(tǒng)脫氮效果差的因素
碳氮比：目前大部分水廠的碳氮比嚴(yán)重失衡，存在氮含量很高，而碳含量很低，不能達(dá)到C/N為3-5。因此，靠其自身是很難達(dá)到脫氮的效果的，只能通過添加外來碳源來平衡碳氮比，以達(dá)到脫氮的效果。但是外加碳源就會額外增加噸水處理成本，因此，選擇合適、高效，同時能降低成本的碳源成為關(guān)鍵。
污泥活性差：目前生化系統(tǒng)脫氮效果差還有一個主要原因是脫氮微生物脆弱，不耐沖擊，硝化和反硝化菌群單一，數(shù)量少，脫氮微生物難以進(jìn)行正常的繁殖，影響脫氮效果。
生化系統(tǒng)管理能力不足，生化處理系統(tǒng)的處理能力還與它們的生長環(huán)境（pH值、水溫、溶解氧、污泥泥齡等有很大關(guān)系，因此，管理人員對生化系統(tǒng)調(diào)試、維護(hù)要具有一定的專業(yè)性。
生化系統(tǒng)缺乏反硝化工藝，可以說反硝化脫氮是目前能夠生化系統(tǒng)能完全脫氮的一個不可少的條件。
外界溫度變化的影響。如冬季溫度很低，低于硝化反應(yīng)所需最適溫度（5-35℃）和反硝化反應(yīng)所需最適溫度（15-30℃）的范圍內(nèi)，使得反應(yīng)速率降低或停止。