1.檢測問題
化驗數(shù)據(jù)有誤。比如廢水顯黃引起氨氮國標(biāo)檢測法（納氏試劑法）的顯示讀數(shù)偏差，檢測時數(shù)據(jù)記錄錯誤、樣品混亂、操作方法或步驟等出現(xiàn)失誤時，勻可能存在檢測出來出水氨氮高于進水氨氮的現(xiàn)象。
對于這個問題，如果采用的是快速檢測包或在線設(shè)備可用標(biāo)準(zhǔn)溶液進行校驗。如果是原水色度顯示讀數(shù)偏差建議可以對原水樣進行合適倍數(shù)的稀釋或者對色素性水樣，可以適當(dāng)濾掉其色度來檢測氨氮。
2.氨化大于硝化
一般情況下廢水中的總氮以氨氮為主，而在某些特定廢水（如氨基酸廢水）中總氮的主要成分為有機氮，有機氮在氨化菌的作用下轉(zhuǎn)化為氨氮，導(dǎo)致系統(tǒng)內(nèi)氨氮升高。
如果氨化反應(yīng)速率高于硝化反應(yīng)速率，那么產(chǎn)生的氨氮就會高于被硝化的氨氮，所以氨氮總量也增加了。
這主要是由于進水中總氮(特別是有機氮)含量較高，再者反硝化反應(yīng)時間不夠造成的。
還有，一些污水廠進水中摻雜了工藝很難處理或處理不了的工業(yè)廢水，嚴(yán)重可導(dǎo)致硝化系統(tǒng)崩潰，氨氮無法轉(zhuǎn)化成硝態(tài)氮。
3.高級氧化
對于可生化性較差的廢水，采用如芬頓氧化法、臭氧法、電化學(xué)處理法等高級氧化法進行處理，在高級氧化的破鏈破環(huán)下，氮元素可以脫離出來形成氨氮，導(dǎo)致出水氨氮比進水高。
4.引入外來氮源
在廢水除碳過程中，為碳氮比需求，會加入一些外來氮源，如出現(xiàn)投加過量，C/N比計算錯誤，碳氮磷比值選用錯誤等，導(dǎo)致微生物消耗不完全，出水氨氮反而升高。
5.污泥解體
污泥老化、中毒、膨脹等導(dǎo)致污泥解體后生物脫氮的降解能力大打折扣，污泥濃度和生物活性的削弱下，氨氮去除率大大降低，使之不如原來的水平。導(dǎo)致出水氨氮高于進水氨氮。
6.物化吸附過于飽和
使用沸石等吸附脫氮處理過于飽和重新釋放出氨氮，導(dǎo)致某時期的出水氨氮高于進水氨氮。
7.還原反應(yīng)
在AO工藝中，A池中缺少反硝化細菌所需的氮源，導(dǎo)致反硝化細菌還原一些硝態(tài)氮形成氨氮。
8.所使用的化學(xué)藥劑帶入氨氮
在廢水處理中引入不明來源的絮凝劑、氧化還原劑、營養(yǎng)劑都有可能會帶來氨氮，導(dǎo)致出水氨氮高于進水氨氮。