污水微生物的生存能力和繁殖能力比較強(qiáng)，不同的生長環(huán)境也會造成微生物的不同。水質(zhì)好可能里面含有的有微生物偏多，水質(zhì)不好也會造成有害微生物的橫行。這些微生物主要通過化學(xué)和生物的方式對他們進(jìn)行甄別和去除。
一、活性污泥凈化性能良好時出現(xiàn)的微生物有鐘蟲、累枝蟲、楯纖蟲、蓋纖蟲、聚縮蟲及各種后生動物及吸管蟲類等固著性生物或匍匐型生物，當(dāng)這些生物的個數(shù)達(dá)到1000個/mL以上，占整個生物個體數(shù)80%以上時，可以斷定這種活性污泥具有較高的凈化效果。
二、活性污泥凈化性能惡化時出現(xiàn)的生物有多波蟲、側(cè)滴蟲、屋滴蟲、豆形蟲等快速游泳的生物。這時絮體很碎約100um大小。嚴(yán)重惡化時只出現(xiàn)多波蟲、屋滴蟲。極端惡化時原生動物和后生動物都不出現(xiàn)。
三、活性污泥由惡化狀態(tài)進(jìn)行恢復(fù)時出現(xiàn)的生物為漫泳蟲、斜葉蟲、斜管蟲、尖毛蟲等緩慢游泳型或匍匐型生物。
四、活性污泥分散解體時出現(xiàn)的生物為蛞蝓簡變蟲、輻射變形蟲等肉足類。這些生物出現(xiàn)數(shù)萬個以上時絮體變小，使處理水渾濁。當(dāng)發(fā)現(xiàn)這些生物劇增時可通過減少回流污泥量和送氣量，能在某種程度上抑制這種現(xiàn)象。
五、活性污泥膨脹時出現(xiàn)的微生物為球衣菌、各種霉菌等，這些絲狀微生物引起污泥膨脹，當(dāng)SVI在200以上時，這些絲狀微生物呈絲屑狀。膨脹污泥中的微型動物比正常污泥少。
六、溶解氧不足時出現(xiàn)的微生物為貝氏硫黃細(xì)菌等。這些微生物適于溶解氧濃度低時生存。這些微生物出現(xiàn)是，活性污泥呈黑色、腐敗發(fā)臭。
七、曝氣過量時出現(xiàn)的微生物，若過曝氣時間持續(xù)很長時，各種變形蟲和輪蟲為優(yōu)勢生物。
八、廢水濃度過低時大量出現(xiàn)的微生物為游仆蟲等。
九、BOD負(fù)荷低時出現(xiàn)的微生物。表殼蟲、鱗殼蟲、輪蟲、寡毛蟲等為優(yōu)勢生物，這些生物多時也是硝化進(jìn)行的指標(biāo)。
十、沖擊負(fù)荷和毒物流入時出現(xiàn)的生物。因為原生動物對環(huán)境條件的變化反應(yīng)比細(xì)菌為快，所以可通過觀察原生動物的變化情況來看沖擊負(fù)荷和毒物對活性污泥的影響。原生動物中對沖擊負(fù)荷和毒物反映最靈敏的楯纖蟲，當(dāng)楯纖蟲急劇減少時，說明發(fā)生了沖擊負(fù)荷和流入少量毒物。